從定義上比較地源熱泵和水源熱泵區別：
水源熱泵和地源熱泵都是從地位熱源的選取來定義的，水源熱泵通常指地位熱源來源于地表水、地下水、海水、污水；地源熱泵有時也被稱為土壤源熱泵，但是地下水作為低位熱源的也可稱為地源熱泵。此外，水環熱泵也可稱為水源熱泵。定義的角度不一樣，叫法也就不一樣。采用冷卻塔散熱的系統不能稱為水源熱泵，直埋地下的如果采用的是打井的方式，利用井水應該成為水源熱泵，否則為土壤源熱泵。
從叫法上比較地源熱泵和水源熱泵區別：水源熱泵和地源熱泵以前確實叫法很亂，已經出臺的地源熱泵相關規范，其中對叫法范圍作了明確說明：
地源熱泵指所有使用大地作為冷熱源的熱泵全部稱為地源熱泵，包括土壤熱泵（即地耦合熱泵），地下水熱泵，地表水熱泵（包括江河湖海的水）等，這是為區別水環熱泵而說的。水源熱泵則是總稱，包括所有以水作為冷熱源的熱泵，當然也包括土壤熱泵和水環熱泵了，這是為區別空氣源熱泵（風冷熱泵）而說的。所以從大分類來說，水源熱泵包括地源熱泵和水環熱泵還有一些特殊的利用低位熱水能量的熱泵（比如利用工業廢水或發電廠冷卻循環水梯級利用等）?？傊?，簡單的說地源熱泵是泛指土壤源熱泵、地表水、地下水、海水、污水源熱泵。但現在人們習慣上把土壤源熱泵叫地源熱泵，把地表水、地下水、海水、污水源熱泵叫水源熱泵。
從分類和優點上比較地源熱泵和水源熱泵區別：
地下水熱泵系統，也就是通常所說的深井回灌式水源熱泵系統。通過建造抽水井群將地下水抽出，通過二次換熱或直接送至水源熱泵機組，經提取熱量或釋放熱量后，由回灌井群灌回地下。
其優點是非常經濟，占地面積小，但要注意必須符合下列條件：水質良好；水量豐富；回灌可靠；符合標準。
對于垂直式埋管系統，其優點有：較小的土地占用，管路及水泵用電少，其缺點是鉆井費用較高；對于水平式埋管系統，其優點有：安裝費用比垂直式埋管系統低，應用廣泛，使用者易于掌握，其缺點有：占地面積大，受地面溫度影響大，水泵耗電量大。
地表水熱泵系統。通過直接抽取或者間接換熱的方式，利用包括江水、河水、湖水、水庫水以及海水作為熱泵冷熱源。歸屬于水源熱泵方式。
其優點有：在10米或更深的湖中，可提供10℃的直接制冷，比地下埋管系統投資要小，水泵能耗較低，高可靠性，低維修要求、低運行費用，在溫暖地區，湖水可做熱源，其缺點有：在淺水湖中，盤管容易被破壞，由于水溫變化較大，會降低機組的效率。
單井換熱熱井，也就是單管型垂直埋管地源熱泵，在國外常稱為"熱井"。這種方式下，在地下水位以上用鋼套作為護套，直徑和孔徑一致；地下水位以下為自然孔洞，不加任何固井設施。
熱泵機組出水直接在孔洞上部進入，其中一部分在地下水位以下進入周邊巖土換熱，其余部分在邊壁處與巖土換熱，換熱后的流體在孔洞底部通過埋至底部的回水管被抽取作為熱泵機組供水，這一方式主要應用于巖石地層，典型孔徑為150mm，孔深450m。
該系統適用于巖石地質地區，該地區巖石鉆孔費用高，而與巖石直接換熱，大大提高換熱效率，節省鉆孔、埋管費用，須得注意分析具體地質情況，做好隔熱、封閉、過濾、實際換熱量測算等具體工作。
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